Да, средства маткапитала можно тратить по нескольким направлениям одновременно. Например, частично использовать на погашение ипотеки, а остальную часть средств — на ежемесячную выплату на ребенка до 3 лет.
При этом, если вы уже получаете такую выплату, то в любой момент можно от нее отказаться, чтобы использовать средства маткапитала на другие цели.